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Bioinformatique des réseaux: de l'analyse des données à des modèles prédictifs

La biologie des systèmes biologiques étudie les processus considérés comme des réseaux d'entités en interaction. Parce que ces systèmes sont multi-échelles et dynamiques, cette approche promet une vision intégrée de la cellule, des tissus, ou encore des organes.

Visant à identifier toutes les pièces constituant les systèmes biologiques complexes et leurs interactions, des programmes systématiques en "-omique" des ont été lancés à plusieurs niveaux, du génome à l'interactome.

Ces dernières années, le passage de la conception centrée sur les gènes à la perception plus globale du processus biologique s'est opéré. Les données issus d'analyses génomiques systématiques s'accumulent rapidement dans les dépôts publics et constituent une source sans précédent de connaissances relatives aux interactions,  à l'expression, à la  régulation, et aux perturbations génétiques.

L'analyse de ces données à haut débit est le défi actuel de la bioinformatique et cela représente notre principal champ d'investigations. En effet, l'extraction des données biologiques pertinentes à partir de ces données implique (i) de développer des outils pour l'analyse de ces réseaux et leur visualisation, (ii) le développement de nouvelles solutions algorithmiques pour le partitionnement de graphes, (iii) la recherche de signaux significatifs, (iv) et l'introduction de données à haut débit dans les modèles dynamiques. Nos capacités et activités couvrent ces aspects qui, ouvrent de nouveaux champs d'investigation dans les domaines des mathématiques, informatiques et statistiques.

Sur le plan biologique, notre groupe de bioinformatique fournit les compétences nécessaires pour analyser  divers gènes, protéines, cellules, ou tissus avec une perspective holistique. Pour cela, nous organisons et analysons des données à haut débit en interne en utilisant des méthodes originales afin de faire face notamment à des questions biologiques liées (i) au déchiffrement des réseaux de régulation génétique et (ii) à la prédiction de la fonction des protéines. La plupart de ces études sont directement liées à des projets expérimentaux réalisés au TAGC, et sont positionnés en amont ou en aval de la partie expérimentale.


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/abachhuy.jpg Marie Artufel Research Engineer This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it
/abachhuy.jpg Lucie Khamvongsa Research Engineer
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abrisebarre.jpg Audrey Brisebarre PhD Student +33(0)491 82 87 23 This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it
agriffon.jpg Aurélien Griffon PhD Student +33(0)491 82 87 39 This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it
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bballester.jpg Benoit Ballester CR2 INSERM +33(0)491 82 87 39 This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it link
cbrun.jpg Christine Brun DR2 CNRS +33(0)491 82 87 12 This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it link
/agonzalez.jpg Aitor González Assistant Professor +33(0)491 26 96 12 This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it link
dputhier.jpg Denis Puthier Assistant Professor +33(0)491 82 87 11 This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it link
jvanhelden.jpg Jacques van Helden Professor This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it link
/andreas.jpg Andreas Zanzoni Post Doctoral Fellow +33(0)491 82 87 12 This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it link
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/jaime.jpg Jaime Castro PhD Student This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it
/ymbouamboua.png Yvon Mbouamboua PhD Student +33(0)491 82 87 39 This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it